天生式AI疾速猜测三维基因组构造

美国麻省理工学院化学家们应用天生式人工智能（AI）技巧，开辟出一种可疾速猜测三维基因组构造的新模子。新模子能在多少分钟内猜测出数千种构造，速率远超现有的试验剖析方式。研讨结果宣布于最新一期《迷信停顿》杂志。 人体每个细胞都含有雷同的遗传序列，但每个细胞只表白此中一局部基因。这种细胞特异性的基因表白形式确保了差别范例细胞之间的差别，而这些表白形式局部取决于遗传物资的三维构造。 新模子名为ChromoGen，旨在从底层DNA序列动身，猜测三维基因组构造。它包含两个构成局部，第一局部是一个深度进修模子，可能“读取”基因组，剖析编码在DNA序列跟染色质可拜访性数据中的信息；第二局部是一个天生式AI模子，经由练习后可能猜测出物理上正确的染色质构象。 练习该模子所用的数据集包含超越1100万个染色质构象，这些数据起源于对16团体类B淋巴细胞系单细胞停止的试验。 ChromoGen模子能无效地捕获序列—构造关联，为每段DNA序列天生多种可能的构造。这是由于DNA是一种十分无序的分子，统一个DNA序列能够发生很多差别的构象。这种方式不只年夜年夜减速了三维基因组构造的猜测进程，也为深刻研讨基因组的三维构造怎样影响细胞的基因表白形式跟功效供给了无力东西。 这一冲破性技巧无望辅助迷信家更快地舆解基因调控机制，增进疾病医治跟生物技巧范畴的提高。